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m6A RNA甲基化从富集纯化到二代测序,一招搞定!

发布者:艾美捷科技    发布时间:2021-08-12     
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炎炎夏日,当大家都捧着西瓜,在电视前收看六边形战士马龙在东京奥运会拼搏的身影时,作为科研工作者,却只能一如既往的在科研岗位上辛苦耕耘。如何提高实验效率,再不耽误发文章的情况下,挤出一点点时间看看比赛呢,估计是很多人共同的心声!

 

工欲善其事必先利其器。一款好的产品能帮助客户极大程度提高实验效率,减少工作量的同时还能降低实验操作带来的风险。比如有一位客户想从RNA开始,完成最终目标——分子生物学分析。他的设计思路如图:

 

total-rna.png

 

乍一看,貌似实验还是挺复杂的。但是不怕,因为小艾有一款出奇制胜的法宝,它就是m6A RNA富集纯化与二代测序试剂盒EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit,货号P-9016。它能帮你从RNA样品开始,在不到6小时的时间内,完成m6A RNA富集纯化——文库建立——二代测序的所有过程,手动操作时间还不到1小时,真可谓一招搞定!

 

我们知道,m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺嘌呤)是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰,占所有RNA甲基化修饰的80%以上,并且存在于各种物种中。m6A主要分布在mRNA上,在非编码 RNA(ncRNA)如tRNA、rRNA和snRNA上也普遍存在。m6A 修饰由甲基转移酶复合物 METTL3 催化,并被 m6A RNA 去甲基化酶 FTO 和 ALKBH5 去除,它们以 α-酮戊二酸 (α-KG) 和 Fe2+ 依赖性方式催化 m6A 去甲基化。

 

已知 METTL3、FTO 和 ALKBH5 在许多生物过程中发挥重要作用,从生长代谢到生育。作为一种动态可逆的修饰方式,m6A RNA可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6A RNA出现在多种重要的细胞生命过程中,意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程,如干细胞分化、生物节律等,同时也参与了多种疾病的发生,包括肿瘤、肥胖和不育等。因此精准地检测m6A,对了解其与人类发育和常见疾病的广泛联系有着重要意义。

 

为准确鉴定m6A,目前已经开发了多种检测方法,包括MeRIP-seq,PA-m6A-seq, miCLIP和m6A-CLIP。其中,MeRIP-seq已被广泛用于m6A分析,但其精确度较低,且需要较大的样本起始量(>300 ug),限制了组织或细胞RNA得率少时对m6A的研究。虽然PA-m6A-seq, miCLIP和m6A-CLIP在分辨率方面进行了改进,但是重复性差且过程复杂,不仅费时(>2天)且成本高。

 

而艾美捷这款EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit,通过CUT&RUN技术原理实现对m6A RNA的富集纯化以及二代测序。CUT&RUN 通过使用靶标特异性一抗(m6A 抗体)和核酸酶分离与富集特异性目的片段。连接的第一链cDNA合成并用适配器标记,再进行文库扩增和加标签,并用二代测序分析。

如果需要对m6A RNA甲基化进行定量,我们还有专门的试剂盒产品P-9005,EpiQuikTM m6A RNA Methylation Quantification Kit(Colorimetric).这可是我们的备货爆款,常年现货哦!

 

二代测序分析.png

 

试剂盒优势:

m6A-Seq试剂盒优势:.jpg

结果展示:

 

结果展示.png

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艾美捷科技(AmyJet Scientific)作为一家具有高端的技术实力、先进的经营管理水平和完善的市场销售体系的生物高科技企业,总部位于武汉光谷高新技术开发区,服务面向全国。艾美捷科技是集进口试剂、实验室耗材销售、技术服务与合约开发为一体的专业化高科技公司,为用户提供专业的前沿资讯、完备的产品、整合的解决方案,及优质的物流服务。为了更好的服务客户,公司组建了一支经验丰富的研发团队-艾美捷生物技术中心,进入研发生产阶段,将更优质的产品推荐给国内生物领域的同仁们!

 

艾美捷科技与国内外优秀的生物试剂供应商优保持着密切的合作关系,目前已成为众多国际知名品牌的中国总代理或一级代理,主要包括:AmyJet、AAT Bioquest、Abbexa、Abnova、Agrisera、Anogen、Biosensis、Biovision、BioVendor、Caisson Labs、Cell Biolabs、Cytoskeleton、Demeditec、Duchefa、Epigentek、Equitech-Bio、EXBio、Fitzgerald、GeneCopoeia、Hycult Biotech、ImmunoReagents、ImmunoStep、Jackson、LifeSensors、LigaTrap、Lumiprobe、Mabtech、Matreya、Norgen Biotek、Origene、ProImmune、ProSpec、ScyTek、Solis BioDyne、SouthernBiotech、StressMarq、SySy、US Biological、TRC等,可以在短时间内为用户提供专业的前沿资讯、完备的产品及物流服务。

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